Биотехнологическая компания Therna Biosciences представила RNA-Logix — платформу на базе искусственного интеллекта, предназначенную для изучения биологии РНК, проверки терапевтических гипотез и разработки кандидатов в лекарственные препараты. Ключевым элементом платформы стала модель BioReason-RNA, созданная совместно с NVIDIA.
Как работает платформа
RNA-Logix объединяет собственные модели-основы Therna для РНК, массивы экспериментальных данных компании и «ИИ-учёного», который исследует биологические вопросы, открывает новые механизмы и предлагает кандидатов в лекарства. Отправной точкой служит научный вопрос: платформа выбирает нужные инструменты из стека Therna, анализирует биологические механизмы заболевания и ищет новые терапевтические пути. Она выдвигает гипотезы о молекулярных механизмах и проверяет их на proprietary-хранилище данных компании, а при расхождении с фактами пересматривает свои объяснения. Цикл быстрой проверки используется также для дообучения reasoning-моделей через reinforcement learning.
BioReason-RNA, построенная на архитектуре NVIDIA Nemotron, выполняет роль «рассуждающего мозга» платформы. Модель предсказывает, как последовательность РНК функционирует в клетке, выстраивая причинно-следственную цепочку молекулярных взаимодействий: от последовательности к пошаговому биологическому объяснению. Каждое звено цепочки можно проверить на массиве экспериментальных данных Therna — там десятки миллионов измерений по сотням тысяч синтетических конструкций и десяткам клеточных контекстов. Это позволяет уточнять гипотезы и отбирать кандидатов для лабораторных испытаний.
Цитаты разработчиков
«Мы построили RNA-Logix так, чтобы она работала с вопросами, которые задаёт биолог, изучающий РНК: что происходит, почему и как это можно изменить для лечения болезни», — отметила глава Therna Назли Азими. По её словам, сотрудничество с NVIDIA охватывает и анализ биологических данных, и разработку BioReason-RNA.
Научный сооснователь компании Хани Годарзи, работающий также в Arc Institute и Калифорнийском университете в Сан-Франциско, подчеркнул отличие от привычных моделей: большинство ИИ-систем в биологии остаются «чёрными ящиками» и не могут объяснить причину прогноза. BioReason-RNA выкладывает причинную цепочку гипотез — от последовательности к молекулярному механизму и последствиям для поражённых клеток. Если цепочка подтверждается, наука получает новое знание; если нет, видно, где именно она не сходится.
Со стороны NVIDIA вышел директор по цифровой биологии Антонио Коста. Он назвал РНК одной из самых сложных областей для применения reasoning-моделей и заявил, что Therna создала базу, благодаря которой рассуждение над РНК стало возможным.
Что дальше
Платформа применима и к РНК как мишени, и к РНК как лекарству: возможности охватывают мРНК, антисмысловые олигонуклеотиды и малые интерферирующие РНК. Доступ к BioReason-RNA Therna предоставит через избранные платформы для исследовательских и отраслевых партнёров; документация и демо-примеры размещены на сайте компании. Остальные модели-основы и наборы данных Chronos остаются внутри компании для собственных программ и партнёрской работы.
Сотрудничество с NVIDIA шире самой модели: RNA-Logix использует CodonFM — открытую модель BioNeMo для дизайна РНК, rapids-singlecell для анализа одиночных клеток и NVIDIA Parabricks для геномного анализа. Заинтересованным в применении платформы к своим данным организациям Therna предлагает связаться напрямую.
